[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: جستجو :: تماس با ما ::
:: دوره 13، شماره 10 - ( دی 1398 ) ::
جلد 13 شماره 10 صفحات 53-71 برگشت به فهرست نسخه ها
متاآنالیز ترنسکریپتومی سرطان دهانه رحم با رویکرد شبکه، به‌منظور شناسایی ژن‌های کلیدی در بیماری
پرویز ملک زاده1 ، امیر زارعی2 ، مهدی صادقی* 3
1- گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم
2- گروه زیست‌شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه سمنان
3- گروه زیست‌شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه سمنان ، mehdisadeghi@semnan.ac.ir
چکیده:   (131 مشاهده)
زمینه و هدف: سرطان دهانه رحم، ازجمله شایع‌ترین بیماری‌ها در زنان است. تشخیص دقیق و درمان بیماری‌های پیچیده نیازمند شناسایی دقیق ویژگی‌های مولکولی بیماری می‌باشد. پروفایل‌های ترنسکریپتومی حاوی اطلاعات با ارزشی در زمینه بیان ژن سلول‌های موردبررسی می‌باشد. به‌کارگیری رویکرد تحلیلی متاآنالیز در کنار روش‌های مبتنی بر شبکه، اطلاعات دقیق و با ارزشی از داده‌های موردمطالعه در اختیار قرار می‌دهد که می‌تواند در توسعه روش‌های تشخیصی و درمانی جدید مورداستفاده قرار گیرد. این مطالعه با هدف بررسی متاآنالیز ترنسکریپتومی سرطان دهانه رحم با رویکرد شبکه، به‌منظور شناسایی ژن‌های کلیدی در بیماری انجام شد.
روش بررسی: در مطالعه حاضر، سه مجموعه داده با 189 نمونه برای سرطان دهانه رحم انتخاب شد. مجموعه داده‌ها به‌طور جداگانه بررسی و نتایج حاصل در جهت به دست آوردن ژن‌ها با الگوی بیان یکسان تلفیق گردید. از این ژن‌ها در مرحله بعد، به‌منظور ساخت شبکه تنظیمی بیان ژنی به کمک پایگاه داده STRING استفاده شد. جهت شناسایی عناصر کلیدی در شبکه که قابل‌تعمیم به سرطان دهانه رحم می‌باشند نیز پارامترهای شبکه (شامل درجه و مرکزیت بینابینی) به‌کار برده شد.
یافته‌ها: در این مطالعه، 194 ژن با الگوی بیانی دقیقاً یکسان، بین سه مجموعه شناسایی گردید. همچنین با آنالیز شبکه به‌دست‌آمده، 12 ژن کلیدی در شبکه تنظیم بیان ژن سرطان دهانه رحم شناسایی شد. (برخی از این ژن‌ها قبلاً به‌عنوان انکوژن گزارش ‌شده و در مسیر تنظیم چرخه سلولی و مسیرهای ترمیم DNA نقش دارند.)
نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج این مطالعه، این ژن‌ها می‌توانند به‌عنوان مارکرهای بالقوه تشخیصی و درمانی برای درمان سرطان دهانه رحم موردتوجه قرار گیرند.
واژه‌های کلیدی: سرطان دهانه رحم، پروفایل بیان ژن، آنالیز ترنسکریپتومی، شبکه تنظیم بیان ژن
متن کامل [PDF 1269 kb]   (59 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشي | موضوع مقاله: علوم پایه
دریافت: ۱۳۹۸/۸/۶ | پذیرش: ۱۳۹۸/۹/۲۳
* نشانی نویسنده مسئول: mehdisadeghi@semnan.ac.ir
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Sadeghi P, Zarei A, Sadeghi M. Meta-Analysis of Cervical Cancer Transcriptome with a Network Approach to Identify Key Genes in the Disease. Qom Univ Med Sci J. 2019; 13 (10) :53-71
URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-2641-fa.html

ملک زاده پرویز، زارعی امیر، صادقی مهدی. متاآنالیز ترنسکریپتومی سرطان دهانه رحم با رویکرد شبکه، به‌منظور شناسایی ژن‌های کلیدی در بیماری. مجله دانشگاه علوم پزشکی قم. 1398; 13 (10) :53-71

URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-2641-fa.html



دوره 13، شماره 10 - ( دی 1398 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله دانشگاه علوم پزشکی قم Qom University of Medical Sciences Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.2 seconds with 32 queries by YEKTAWEB 4016