[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: جستجو :: تماس با ما ::
:: دوره 10، شماره 10 - ( دی 1395 ) ::
جلد 10 شماره 10 صفحات 25-33 برگشت به فهرست نسخه ها
طراحی و بهینه‌سازی تست PCR برای تشخیص سریع پاتوتایپ‌های انترواگریگیتیو و انتروتوکسی‌ژنیک اشرشیاکلی
محمد سلیمانی1، عباس مروتی *2، علی جوادی3
1- دانشگاه آزاد اسلامی، قم
2- دانشگاه آزاد اسلامی، قم ، abbasmorovvati@gmail.com
3- دانشگاه علوم پزشکی تهران
چکیده:   (483 مشاهده)

زمینه و هدف: اشرشیاکلی به‌عنوان یکی از مهم‌ترین عوامل ایجادکننده بیماری اسهالی حاد در دنیا مطرح است. بیماری‌های اسهالی یکی از علل اصلی مرگ و میر در میان کودکان کشورهای درحال توسعه می‌باشند. این مطالعه با هدف توسعه تکنیک PCR برای تشخیص اختصاصی ژن‌های ویرولانس پاتوتایپ‌های انترتوکسی‌ژنیک اشرشیاکلی (ETEC) و انترواگریگیتیو و اشرشیاکلی (EAEC) انجام شد.

روش بررسی: در این مطالعه برای تشخیص پاتوتایپ‌ها ETEC-EAEC، از ژن‌های اختصاصی st و lt (برای تشخیص پاتوتایپ ETEC) و از ژن اختصاصی aafII (برای شناسایی پاتوتایپ EAEC) استفاده شد. این تکنیک PCR برای این سه ژن طراحی و بهینه گردید. محصولات واکنش برای هریک از این ژن‌ها، در وکتور pTZ57R/T به‌عنوان کنترل مثبت، کلون و مورد استفاده قرار گرفت. میزان حساسیت پرایمر‌ها با محاسبه کمترین میزان تشخیص (Limit of Detection) و استفاده از ژنوم سایر باکتری‌ها به‌عنوان بررسی اختصاصیت پرایمر‌ها ارزیابی شد.

یافته‌ها: با توجه به نتایج آنالیز محصولات PCR بر روی ژل الکتروفورز باند‌های مورد نظر برای ژن aafII، lt و st به ترتیب 384 ، 459 و 150 جفت باز به دست آمد. همچنین واکنش ژنوم باکتری‌های کنترل با پرایمر‌های طراحی‌شده، منفی بود. حد تشخیص براساس تعداد کپی برای ژن‌های st، lt و aafII به ترتیب برابر 390 ، 1500 و 2500 کپی به دست آمد.

نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج این مطالعه، طراحی این گونه تست‌ها در ایران به‌عنوان یک پیشرفت در زمینه بهبود تشخیص سریع و دقیق پاتوژن‌ها و تفکیک در نوع پاتوتایپ‌های اشرشیاکلی می‌باشد.

واژه‌های کلیدی: اشرشیا کلی، واکنش زنجیره‌ای پلیمراز، اسهال
متن کامل [PDF 637 kb]   (339 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشي | موضوع مقاله: میکروب شناسی
دریافت: ۱۳۹۴/۱۲/۵ | پذیرش: ۱۳۹۵/۱/۲۹ | انتشار: ۱۳۹۵/۱۰/۵
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

کد امنیتی را در کادر بنویسید >



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Soleimani M, Morovvati A, Javadi A. Design and Optimization of PCR Assay for Rapid Detection of Enterotoxigenic and Enteroaggregative Pathotypes of E. coli . Qom Univ Med Sci J . 2017; 10 (10) :25-33
URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-330-fa.html
سلیمانی محمد، مروتی عباس، جوادی علی. طراحی و بهینه‌سازی تست PCR برای تشخیص سریع پاتوتایپ‌های انترواگریگیتیو و انتروتوکسی‌ژنیک اشرشیاکلی . مجله دانشگاه علوم پزشکی قم. 1395; 10 (10) :25-33

URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-330-fa.html

دوره 10، شماره 10 - ( دی 1395 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله دانشگاه علوم پزشکی قم Qom University of Medical Sciences Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.125 seconds with 798 queries by yektaweb 3455