[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: جستجو :: تماس با ما ::
:: دوره 13، شماره 6 - ( شهریور 1398 ) ::
جلد 13 شماره 6 صفحات 47-54 برگشت به فهرست نسخه ها
نرخ کشف کاذب در آزمون‌فرض‌ جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته‌ همزمان بر داده‌های ریزآرایه
محسن صالحی* 1، اسحاق الماسی2
1- گروه آمار، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم ، m.salehi@qom.ac.ir
2- گروه ریاضی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه ایلام
چکیده:   (335 مشاهده)
زمینه و هدف: در سال‌های اخیر، فن‌آوری‌های جدید منجر به تولید حجم انبوهی از داده‌ها شده و در حوزه‌ زیستی، فناوری ریزآرایه نیز به‌صورت چشمگیری توسعه یافته است. در این میان، جهت مقایسه گروه کنترل با دو یا چند گروه آزمایشی، همچنین یافتن ژن‌هایی با بیان متفاوت، از آزمون فیشر استفاده می‌شود. در این مطالعه نرخ کشف کاذب در آزمون‌فرض‌ جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته‌ همزمان بر داده‌های ریزآرایه بررسی گردید.
روش بررسی: در این مطالعه، ابتدا با شبیه‌سازی و انتخاب سه حالت مختلف برای نمونه‌های کنترل و آزمایشی‌، نرخ کشف کاذب با استفاده از دو روش آزمون جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته محاسبه گردید، سپس این دو روش بر روی 8799 ژن مربوط به سلول مغز 29 موش (در سه گروه سنی جوان، میانسال و پیر) اعمال گردید و تأثیر فرآیند سن مغز بر افزایش ایجاد بیماری آلزایمر مورد بررسی قرار گرفت.
یافته‌ها: نتایج نشان داد استفاده از روش آزمون جایگشتی فیشر، نرخ کشف کاذب را نمی‌تواند کنترل کند، ولی روش جایگشتی‌ تعدیل‌یافته بهتر عمل کرده و اختلافات واقعی معنی‌دار را درست‌تر تشخیص می‌دهد؛ لذا مقدار FP در روش دوم کاهش خواهد یافت.
نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج این مطالعه، استفاده از روش‌های مرسوم ازجمله آزمون جایگشتی فیشر که مبنای تحلیل داده‌های زیستی در بسیاری از نرم‌افزارها می‌باشد، در داده‌های بزرگ مقیاس، ازجمله داده‌های ریزآرایه کارایی مطلوب را ندارد و نرخ کشف کاذب را نمی‌تواند کنترل کند؛ درحالی‌که روش جایگشتی تعدیل‌یافته با عملکرد بهتر در کنترل نرخ کشف کاذب، نتایج قابل‌اعتمادتری در پی دارد.
واژه‌های کلیدی: ریزآرایه، بیان ژن، بیماری آلزایمر، نرخ کشف کاذب، روش‌ها.
متن کامل [PDF 673 kb]   (63 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشي | موضوع مقاله: آمار
دریافت: ۱۳۹۷/۱۱/۱۰ | پذیرش: ۱۳۹۸/۴/۱۰
* نشانی نویسنده مسئول: قم دانشگاه قم دانشکده علوم پایه گروه آمار
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA



XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Salehi M, Almasi I. The False Discovery Rate in Simultaneous Fisher and Adjusted Permutation Hypothesis Testing on Microarray Data. Qom Univ Med Sci J. 2019; 13 (6) :47-54
URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-2397-fa.html

صالحی محسن، الماسی اسحاق. نرخ کشف کاذب در آزمون‌فرض‌ جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته‌ همزمان بر داده‌های ریزآرایه. مجله دانشگاه علوم پزشکی قم. 1398; 13 (6) :47-54

URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-2397-fa.html



دوره 13، شماره 6 - ( شهریور 1398 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله دانشگاه علوم پزشکی قم Qom University of Medical Sciences Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.23 seconds with 32 queries by YEKTAWEB 3960