[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: جستجو :: تماس با ما ::
:: دوره 9، شماره 10 - ( دی 1394 1394 ) ::
جلد 9 شماره 10 صفحات 8-15 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی سطح بیان ژن‌های عامل سرطان لمفوما به کمک ارائه مدل دسته‌بند تقریبی فازی
زهرا روزبهانی* 1، علی کتان‌فروش2، منصور ابراهیمی3، منصوره یاری‌ایلی4
1- دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه قم ، z.roozbahani@stu.qom.ac.ir
2- دانشکده علوم ریاضی، دانشگاه شهید بهشتی
3- ‌گــروه زیست‌شناسی، دانشگاه قم
4- دانشکده فنی، دانشگاه قم
چکیده:   (1906 مشاهده)

زمینه و هدف: سرطان یکی از دلایل عمده مرگ و میر در دنیای امروز است و به‌عنوان یکی از مهم‌‎‎ترین مشکلات سلامت جوامع محسوب می‌شو‎د. اکثر روش‌های پیشنهادی جهت دسته‌بندی سرطان ‎‎به کمک داده‌های بیان ژن مانند یک جعبه سیاه عمل کرده‏ و قابلیت تفسیرپذیری زیستی ندارند. این مطالعه با هدف معرفی روشی بهینه با قابلیت تفسیر داده‌های بیان ژن انجام شد. روش بررسی: در این مطالعه، روش ترکیبی پالایشی - پوششی برای انتخاب ویژگی زیرمجموعه‌ای از ژن‌های مؤثر در سرطان مورد استفاده قرار گرفت که این عمل باعث کاهش چشمگیر تعداد نمونه‌ها در مقایسه با تعداد ژن‌ها شد. همچنین در این مطالعه با ترکیب روش‌های خوشه‌بندی فازی، مجموعه‌های تقریبی و اعتبارسنجی K- دسته‌ای؛ به گسسته‌سازی داده‌ها، تولید و کاهش قوانین و ارزیابی نتایج پرداخته شد. براین اساس، روش جدیدی با قابلیت           تفسیرپذیری زیستی و استخراج معانی از داده‌های بیان ژن‏ معرفی گردید که این روش                Fuzzy Rough set ‎Classification نامیده شد. یافته‌ها: با استفاده از روش پالایشی – پوششی انتخاب ویژگی در ریزآرایه لمفوما، از میان 4029 ژن‏، 6 ژن انتخاب شد. در روش دسته‌بندی تقریبی فازی جهت تولید یک مدل دسته‌بند با قابلیت تفسیر داده‌های بیان ژن، دو قانون تولید شده است. نتیجه‌گیری: در این روش با استفاده از توابع رتبه‌بندی، مهم‌ترین قوانین فازی انتخاب شد که علاوه بر قابلیت تولید یک مدل دسته‌بند کارآمد، قابلیت تفسیر داده‌های بیان ژن را ممکن      می‌سازد. یکی دیگر از ویژگی‌های برجسته این روش، حل موفقیت‌آمیز مسئله عدم تناسب میان تعداد نمونه‌ها و ژن‌ها در ریزآرایه‌ها به روش پیشنهادی‎ پالایشی - پوششی انتخاب ویژگی بوده است.

واژه‌های کلیدی: لمفوما، تشخیص اولیه سرطان، سطح بیان ژن، تحلیل میکروآرایه.
متن کامل [PDF 394 kb]   (899 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشي | موضوع مقاله: داخلی
دریافت: ۱۳۹۴/۱۱/۲۴ | پذیرش: ۱۳۹۴/۱۲/۱ | انتشار: ۱۳۹۴/۱۲/۱
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Roozbehani Z, Katanforoush A, Ebrahimi M, Yari Ili M. A Study of Expression Level of Genes Causing Lymphoma Cancer Using Fuzzy-rough Set Classifier Model. Qom Univ Med Sci J. 2015; 9 (10) :8-15
URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-241-fa.html

روزبهانی زهرا، کتان‌فروش علی، ابراهیمی منصور، یاری‌ایلی منصوره. بررسی سطح بیان ژن‌های عامل سرطان لمفوما به کمک ارائه مدل دسته‌بند تقریبی فازی. مجله دانشگاه علوم پزشکی قم. 1394; 9 (10) :8-15

URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-241-fa.html



دوره 9، شماره 10 - ( دی 1394 1394 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله دانشگاه علوم پزشکی قم Qom University of Medical Sciences Journal
Persian site map - English site map - Created in 0.2 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3781