<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Qom University of Medical Sciences Journal</title>
<title_fa>مجله دانشگاه علوم پزشکی قم</title_fa>
<short_title>Qom Univ Med Sci J</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://journal.muq.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-7799</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2008-1375</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.32598/QUSMJ</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1395</year>
	<month>4</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2016</year>
	<month>7</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>10</volume>
<number>5</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>پیش‌بینی روش‌های نوین تشخیص و درمان فشار خون شریانی ریوی با استفاده از روش‌های سیستم بیولوژی</title_fa>
	<title>Prediction of New Diagnostic and Therapeutic Approaches in Pulmonary Arterial Hypertension by Systems Biology Metho</title>
	<subject_fa>روانشناسی</subject_fa>
	<subject>روانشناسی</subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;زمینه و هدف: &lt;/strong&gt;بیماری فشار خون شریانی ریوی، بیماری رگ&#8204;های نازک بوده که با فشار بالا و تنگی رگ&#8204;ها همراه است و نهایتاً در بطن راست اختلال ایجاد می&#8204;کند. این مطالعه با هدف یافتن روش&#8204;های نوین مناسب تشخیصی و درمانی با استفاده از روش&#8204;های مختلف سیستم بیولوژی و بیوانفورماتیک انجام شد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;روش بررسی: &lt;/strong&gt;در این مطالعه داده&#8204;های میکرواری دو گروه (گروه سالم به&#8204;عنوان کنترل و گروه فشار خون شریانی ریوی به&#8204;عنوان گروه تیمار) توسط نرم افزار &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;GEO2R&lt;/span&gt; مقایسه شد. همچنین بررسی&#8204;های پروتئین کینازی، فاکتورهای رونویسی، واکنش&#8204;های پروتئینی، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;microRNA&lt;/span&gt; و دارویی به ترتیب توسط پایگاه&#8204;های داده&#8204;ای &amp;nbsp;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;KEA&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;ChEA&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Gene2Network&lt;/span&gt;،&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;TargetScan microRNA&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;Connectivity Map (CMAP)&lt;/span&gt; بر روی دو دسته ژن&#8204;های افتراقی انجام گرفت. در نهایت، با اطلاعات به&#8204;دست&#8204;آمده، شبکه پروتئینی ژن&#8204;های افتراقی فشار خون شریانی ریوی کشیده شد.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;یافته&#8204;ها: &lt;/strong&gt;فاکتورهای رونویسی &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SUZ12&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;SP1&lt;/span&gt; و فاکتور رونویسی &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;MYC&lt;/span&gt; به ترتیب به&#8204;عنوان فاکتورهای رونویسی مهم ژن&#8204;های افزایش بیان&#8204;یافته و کاهش بیان&#8204;یافته، پیش&#8204;بینی وگزارش شدند. همچنین کیناز &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PAK3&lt;/span&gt; و کیناز &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;IRAK3&lt;/span&gt; به&#8204;ترتیب به&#8204;عنوان کینازهای مهم ژن&#8204;های افزایش بیان&#8204;یافته و کاهش بیان&#8204;یافته پیش&#8204;بینی و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PAK3&lt;/span&gt; جهت تشخیص سریع و کاندید درمان گزارش شد. به&#8204;طور خلاصه پروستاگلاندین جی 2 &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;(PGJ&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;)&lt;/span&gt; با دوز 00001/0 مولار با مدت زمان هر 6 ساعت یک&#8204;بار و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;microRNA&lt;/span&gt;&#8204;های &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;miR-144&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;miR-501&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; برای مهار ژن&#8204;های افزایش بیان&#8204;یافته بیماری فشار خون شریانی ریوی، پیش&#8204;بینی و به&#8204;عنوان کاندید درمان گزارش شدند.&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;strong&gt;نتیجه&#8204;گیری: &lt;/strong&gt;با استفاده از ابزارهای سیستم بیولوژی می&#8204;توان مسیر جدیدی را در راستای تشخیص و درمان بیماری فشار خون شریانی ریوی به کمک مارکر &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;PAK3&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;em&gt;،&lt;/em&gt; &lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;miR-144&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;،&lt;/p&gt;

&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&amp;nbsp;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;miR-501&lt;/span&gt;&lt;/em&gt; و داروی پروستاگلاندین &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;J&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;&lt;/span&gt; نشان داد.&lt;/p&gt;
&lt;p dir=&quot;RTL&quot;&gt;&lt;/p&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Background and Objectives: &lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;The pulmonary arterial hypertension is a narrow vessel disease, which is associated with hypertension and &lt;em&gt;arterial stenosis&lt;/em&gt; and, finally, disorder of the right ventricle. This study was conducted with the purpose of finding new diagnostic and therapeutic approaches in pulmonary arterial hypertension using different systems biology and bioinformatics methods.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Methods:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; In this study, microarray data of two groups (normal group as the control and pulmonary arterial hypertension as the treatment group), were compared using GEO2R software. Also, Protein kinase analysis, transcription factor analysis, protein-protein interactions, microRNA, and pharmaceutical analyzes, were performed on two sets of differential genes using KEA, ChEA, Genes2 Networks, Target Scan microRNAs, and Connectivity Map (CMAP) databases. software respectively. Finally, the protein network of differential genes of pulmonary arterial hypertension was mapped using the obtained date.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Results:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; SUZ12 and SP1 transcription factors and MYC transcription factor were, respectively, predicted and reported as the important transcription factors of up-regulated and down-regulated genes. Moreover, PAK3 and IRAK3 were reported as the kinases of up-regulated genes and down-regulated genes, respectively, and PAK3 as a rapid diagnosis and therapeutic candidate. Briefly, Prostaglandin J&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt; (PGJ&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt;) at a dose of 0.00001 M every 6 hours, and microRNAs &lt;em&gt;miR-144&lt;/em&gt; and &lt;em&gt;miR-501&lt;/em&gt; were predicted as suppressor of up-regulated genes of pulmonary arterial hypertension and reported as a therapeutic candidate.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Conclusion: &lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;Application of systems biology methods could show a path towards diagnosis and treatment of pulmonary arterial hypertension using PAK3 marker, &lt;em&gt;miR-144&lt;/em&gt;, and &lt;em&gt;miR-501&lt;/em&gt;, and Prostaglandin J&lt;sub&gt;2&lt;/sub&gt; drug.&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa> فشار خون شریانی ریوی؛ نقشه‌های فعل و انفعالات پروتئین؛ دارودرمانی؛ میکروآر ان آهای درمانی؛ سیستم بیولوژی. </keyword_fa>
	<keyword>Pulmonary arterial hypertension, Protein interaction maps, Drug therapy, MicroRNAs therapy, System biology tools.</keyword>
	<start_page>9</start_page>
	<end_page>20</end_page>
	<web_url>http://journal.muq.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-530&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Ali </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Salari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سالاری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>asalari1365@gmail.com</email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Young Researchers &amp; Elite Club, Borujerd Branch, Islamic Azad University, Borujerd, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامی، بروجرد، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>  Fatemeh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Salarian</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فاطمه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سالاریان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Faculty of Basic Science, Payame Noor University, Qom, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>2انشکده علوم پایه، دانشگاه پیام نور، قم، ایران.</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
