fa متاآنالیز ترنسکریپتومی سرطان دهانه رحم با رویکرد شبکه، به‌منظور شناسایی ژن‌های کلیدی در بیماری علوم پایه علوم پایه مقاله پژوهشي Original Article <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">زمینه و هدف: </span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">سرطان دهانه رحم، ازجمله شایع‌ترین بیماری‌ها در زنان است. تشخیص دقیق و درمان بیماری‌های پیچیده نیازمند </span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">شناسایی دقیق ویژگی‌های مولکولی بیماری می‌باشد. پروفایل‌های ترنسکریپتومی</span></span> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">حاوی اطلاعات با ارزشی در زمینه بیان ژن سلول‌های موردبررسی می‌باشد. به‌کارگیری رویکرد تحلیلی متاآنالیز در کنار روش‌های مبتنی بر شبکه، اطلاعات دقیق و با ارزشی از داده‌های موردمطالعه در اختیار قرار می‌دهد که می‌تواند در توسعه روش‌های تشخیصی و درمانی جدید مورداستفاده قرار گیرد. این مطالعه با هدف بررسی متاآنالیز ترنسکریپتومی سرطان دهانه رحم با رویکرد شبکه، به‌منظور شناسایی ژن‌های کلیدی در بیماری انجام شد.</span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">روش بررسی:</span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> در مطالعه حاضر، سه مجموعه داده با 189 نمونه برای سرطان دهانه رحم انتخاب شد. مجموعه داده‌ها به‌طور جداگانه بررسی و نتایج حاصل در جهت به دست آوردن ژن‌ها با الگوی بیان یکسان تلفیق گردید. از این ژن‌ها در مرحله بعد، به‌منظور ساخت شبکه تنظیمی بیان ژنی به کمک پایگاه داده </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">STRING</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> استفاده شد. جهت شناسایی عناصر کلیدی در شبکه که قابل‌تعمیم به سرطان دهانه رحم می‌باشند نیز پارامترهای شبکه (شامل درجه و مرکزیت بینابینی) به‌کار برده شد.</span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">یافته‌ها: </span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">در این مطالعه، 194 ژن با الگوی بیانی دقیقاً یکسان، بین سه مجموعه شناسایی گردید. همچنین با آنالیز شبکه به‌دست‌آمده، 12 ژن کلیدی در شبکه تنظیم بیان ژن سرطان دهانه رحم شناسایی شد. (برخی از این ژن‌ها قبلاً به‌عنوان انکوژن گزارش ‌شده و در مسیر تنظیم چرخه سلولی و مسیرهای ترمیم </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> نقش دارند.)</span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">نتیجه‌گیری: </span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">با توجه به نتایج این مطالعه، این ژن‌ها می‌توانند به‌عنوان مارکرهای بالقوه تشخیصی و درمانی برای درمان سرطان دهانه رحم موردتوجه قرار گیرند.</span></span> <strong><em>Background and Objectives: </em></strong>Cervical cancer is one of the most prevalent cancers among women. Accurate diagnosis and treatment of complex diseases require precise identification of molecular characteristics of the disease. Transcriptome profiles provide valuable information on gene expression of the studied cells. Applying meta-analysis approache along with network-based approaches provides precise and valuable information about studied data, which can be used in developing new diagnostic and therapeutic methods. The aim of this study was meta-analysis investigation of cervical cancer transcriptome using a network approach in order to identify key genes in the disease.<br> &nbsp;<br> <strong><em>Methods: </em></strong>In the current study, three data-sets including 189 cervical cancer samples, were selected for cervical cancer. The data sets were analyzed separately and the results were integrated to obtain genes with the same expression pattern. These genes were used to construct gene regulatory network by STRING database. Network parameters (including degree and betweenness centrality), were used to explore key elements in the network, which are generalizable to cervical cancer.<br> &nbsp;<br> <strong><em>Results: </em></strong>In this study, 194 genes with same expression pattern, were identified in the three data-sets. Moreover, the obtained network analysis led to identification of 12 key genes in the gene expression regulatory network. Some of these genes have been previously reported as oncogenes and are involved in cell cycle regulation and DNA repair pathways.<br> &nbsp;<br> <strong><em>Conclusion: </em></strong>According to the results of this study, these genes can be considered as the potential diagnostic and therapeutic markers for the treatment of cervical cancer. سرطان دهانه رحم, پروفایل بیان ژن, آنالیز ترنسکریپتومی, شبکه تنظیم بیان ژن Uterine cervical neoplasms, Gene expression profiling, Gene regulatory network, Transcriptome analysis 53 71 http://journal.muq.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1878-1&slc_lang=fa&sid=1 Parviz Sadeghi پرویز ملک زاده mehdisadeghi@semnan.ac.ir 0000-0002-8940-7397 No Department of Biology, Faculty of Basic Science, University of Qom گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم Amir Zarei امیر زارعی mehdisadeghi@semnan.ac.ir 0000-0002-9673-6455 No Department of Cellular & Molecular Biology, Faculty of Basic Science, Semnan University گروه زیست‌شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه سمنان Mehdi Sadeghi مهدی صادقی mehdisadeghi@semnan.ac.ir 0000-0001-6704-4591 Yes Department of Cellular & Molecular Biology, Faculty of Basic Science, Semnan University گروه زیست‌شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه سمنان