Qom University of Medical Sciences Journal

fa مطالعه کمّی میزان بیان lncRNA HOX A11As در بیماران ایرانی مبتلابه گلیوبلاستوما Investigation of Long Non-coding RNA HOX A11-AS Expression in Iranian Patients with Glioblastoma: A Quantitative Study علوم پایه علوم پایه مقاله پژوهشي Original Article زمینه و هدف: گلیوبلاستوما یکی از بدخیم‌ترین و رایج‌ترین تومورهای مغزی است که حدود نیمی از گلیوماها را به خود اختصاص می‌دهد. گلیوبلاستوما یکی از تومورهای سیستم عصبی مرکزی (CNS: Central Nervous System) است که از بافت گلیال مغز نشئت می‌گیرد. هدف از این مطالعه بررسی تغییرات بیان lncRNA HOXA11-AS&rlm; &rlm;به‌عنوان بیومارکر احتمالی در گلیوماست. روش بررسی: بدین منظور پس از بررسی پرونده پزشکی بیماران بیمارستان امام حسین تهران، گرفتن رضایت‌نامه کتبی از بیماران و گرفتن کد اخلاق این پژوهش در بیمارستان امام حسین انجام شد. بلوک‌های پارافینه شامل بیوپسی بافت توموری مغز از سال 1394 تا 1396 جمع‌آوری شد و متخصص پاتولوژیست آن‌ها را تأیید و تعیین درجه کرد. در این پروژه، 50 نمونه درجه 1 و2 و 50 نمونه درجه 3 و4 بررسی شد. برای تمام نمونه‌های بافتی اهداشده بیماران، استخراج RNA و سنتز cDNA صورت گرفت. سپس پرایمر و پروب اختصاصی طراحی و میزان بیان ژن HOXA11-AS&rlm; &rlm; با استفاده از روش Real-time PCR بررسی شد. میانگین سن افراد بررسی‌شده 416/16 ± 70/43 سال بود. تجزیه‌وتحلیل آماری داده‌ها به‌صورت توصیفی و تحلیلی با استفاده از نرم‌افزار SPSS نسخه 20 انجام شود. همچنین برای مقایسه میزان بیان این ژن در بافت تومورال با درجه پایین‌تر و بافت تومورال با درجه بالاتر از آزمون آماری تی مستقل استفاده شد. یافته‌ها: نتایج نشان داد نمونه‌های توموری با درجه سه و چهار، 76/2 برابر نمونه‌های توموری با درجه یک و دو افزایش بیان (fold change) داشتند که ازنظر آماری این فاصله معنی‌دار است. نتیجه‌گیری: نتایج بررسی کمّی نشان داد بیان ژن HOXA11-AS&rlm; افزایش معنی‌داری با افزایش درجه بیماری دارد (0002/0P=). Background and Objectives: Glioblastoma is one of the most malignant and common brain tumors, accounting for about half of all gliomas. Glioblastoma is a central nervous system tumor that originates from the glial tissue of the brain. The present study aimed to investigate changes in the expression of long non-coding RNA HOXA11-AS as a possible biomarker in glioma.   Methods: For the purposes of the present study, first, the medical records of the patients in Imam Hossein Hospital in Tehran, Iran were reviewed. The ethical considerations were respected as well; accordingly, written informed consent was obtained from the patients and the code of ethics was achieved as well. Finally, the paraffin blocks, including the biopsy of brain tumor tissue of the patients who referred to Imam Hossein Hospital during 2015-17 were collected and their degrees were confirmed by the pathologist. In total, 50 samples of grades 1 and 2 as well as 50 samples of grades 3 and 4 were examined in this research project. The RNA extraction and cDNA synthesis were performed for all the tissue samples donated by the patients. Subsequently, a specific primer and probe were designed and the expression of the HOXA11-AS gene was investigated using real-time polymerase chain reaction technique. The mean age of the subjects was 43.70±16.416 years. The collected data were analyzed in SPSS software (version 20) using descriptive and analytical statistics. Moreover, the expression levels of this gene in lower- and higher-grade tumor tissues were compared using the unpaired samples t-test.   Results: Based on the results, the tumor samples with grade three and four underwent a 2.76 fold increase in expression (fold change), compared to tumor samples with grade one and two. This difference was statistically significant.   <pre> Conclusion: Based on the findings, it can be concluded that the expression of the HOXA11-AS gene has a significant positive relationship with the degree of disease (P=0.0002).</pre> پروتئین HOXA11 زنوپوس, گلیوبلاستوما, RNA بلند بدون کدگذاری. Glioblastoma, HOXA11 protein, Long non-coding, RNA, Xenopus. 22 29 http://journal.muq.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2028-1&slc_lang=fa&sid=1 Mansoureh Shabani منصوره شعبانی shabani.mansoureh@gmail.com 0000-0001-8592-4277 No Islamic Azad University, Science and Research Branch, Faculty of Basic Sciences, Department of Genetics, Tehran, Iran. گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران. Shahla Mohammad Ganji شهلا محمد گنجی shahlamg@yahoo.com 0000-0003-2032-8209 Yes National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology, Institute of Medical Biotechnology, Department of Molecular Medicine, Tehran, Iran. گروه پزشکی مولکولی، پژوهشکده بیوتکنولوژی پزشکی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست‌فناوری، تهران، ایران. Iman Salahshourifar ایمان سلحشوری فر isalahshouri@gmail.com 0000-0001-9987-1188 No Islamic Azad University, Science and Research Branch, Faculty of Basic Sciences, Department of Genetics, Tehran, Iran. گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.