<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Qom University of Medical Sciences Journal</title>
<title_fa>مجله دانشگاه علوم پزشکی قم</title_fa>
<short_title>Qom Univ Med Sci J</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://journal.muq.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-7799</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2008-1375</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.32598/QUSMJ</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1393</year>
	<month>10</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2015</year>
	<month>1</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>8</volume>
<number>6</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>بررسی مولکولی ژن oapA در سویه‌های هموفیلوس آنفلوانزای ایزوله‌شده از ایران، به‌عنوان کاندید در طراحی واکسن بومی ‌علیه این باکتری</title_fa>
	<title>Molecular Analysis of Oapa Gene in Haemophilusinfluenzae Strains Isolated from Iran: As a Domestic Vaccine Candidate</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>مقاله پژوهشي</content_type_fa>
	<content_type>Original Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;p&gt;زمینه و هدف: باکتری هموفیلوس آنفلوانزا می&#8204;تواند به&#8204;عنوان پاتوژن بخش تنفسی انسان عمل کند. عفونت&#8204; ناشی از این باکتری به&#8204;طور سنتی به&#8204;وسیله آنتی&#8204;بیوتیک&#8204;ها&#8204; درمان می&#8204;شود. استفاده از واکسن&#8204;های کونژوگه در مهار بیماری&#8204;های ناشی از این باکتری نیز بسیار موفقیت&#8204;آمیز بوده است. در طراحی این واکسن&#8204;ها از کپسول پلی&#8204;ساکاریدی هموفیلوس آنفلوانزا و پروتئین&#8204;های ایمونوژن استفاده می&#8204;شود. این مطالعه با هدف بررسی مولکولی ژن oapA به&#8204;عنوان ژن پروتئین ایمونوژنیک حفاظت&#8204;شده و کاندید در طراحی واکسن انجام شد. روش بررسی: تعدادی سویه بالینی هموفیلوس آنفلوانزا از بیمارستان میلاد در تهران تهیه و پس از انجام تست&#8204;های تشخیصی موجود، تست&#8204;های بیوشیمیایی جهت تشخیص بیوتایپ سویه&#8204;ها انجام گرفت. در ادامه، DNA از طریق جوشاندن، استخراج و واکنش PCR اختصاصی جهت آنالیز مولکولی ژن oapA طراحی گردید. در نهایت، تعیین توالی محصولات PCR، به&#8204;منظور تأیید نتایج صورت گرفت. یافته&#8204;ها: نتایج واکنش PCR نشان داد 79% از سویه&#8204;های مورد بررسی، حدود 99-95% به توالی&#8204;های نوکلئوتیدی ژن oapA هموفیلوس آنفلوانزا در NCBI شباهت دارند و21% باقیمانده از سویه&#8204;هادارای یک حذف حدود 125 نوکلئوتیدیبوده و 96-94% شبیه به توالی&#8204;های موجود در NCBI هستند. در همه سویه&#8204;هایی که این حذف 125 نوکلئوتیدی را نشان دادند (سویه&#8204;های&amp;nbsp;&amp;nbsp; non-typeable &amp;nbsp;و سویه&#8204;های تیپ b) شباهت 99-95% برقرار بود.نتایج تعیین بیوتایپ نشان داد سویه&#8204;های مورد مطالعه، مربوط به بیوتایپ&#8204;های مختلف می&#8204;باشد. نتیجه&#8204;گیری: طبق نتایج این مطالعه پیشنهاد می&#8204;شود استفاده از پروتئین ژن حفاظت&#8204;شده oap A در تولید واکسن علیه تیپ b این باکتری بیشتر مورد توجه قرار گیرد. کلید واژه&#8204;ها: هموفیلوس آنفلوانزا ؛ ژن oapA ؛ واکنش زنجیره&#8204;ای پلیمراز.&lt;/p&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Background and Objectives:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;&lt;em&gt;Haemophilusinfluenzae&lt;/em&gt; is a bacterium that can act as a pathogen of human respiratory tract. Its infections have been traditionally treated with antibiotics, and then the use of conjugate vaccines has been very successful in prevention of infectious diseases. These vaccines consisted of capsular polysaccharide of &lt;em&gt;H. influenzae&lt;/em&gt;with an immunogenic protein. The aim of this study was molecular analysis of &lt;em&gt;oapA&lt;/em&gt;gene in Iranian&lt;em&gt;H. influenzae&lt;/em&gt; strains as a conserve immunogenic protein for vaccine candidate.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Methods:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt;Clinical&lt;em&gt;H. influenzae&lt;/em&gt; strains were collected from Milad Hospital in Tehran, and cultured on chocolate agar. After diagnostic test, biochemical tests were performed for distinguishing strains biotype. The DNA extracted by boiling method and specific PCR reactions were designed for &lt;em&gt;oapA&lt;/em&gt;gene molecular analysis. Finally sequencing of PCR products was performed for confirming our results.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Results:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; The results of PCR exhibited that 79% of clinical samples had 95-99% similarity to NCBI sequences of &lt;em&gt;H. influenzaeoapA&lt;/em&gt; gene, and the remaining 21% had a 125 nucleotide deletion and 94-96% similarity to NCBI sequences. Also this study showed that all strains having 125 nucleotide deletion (Nontypeable&lt;em&gt;H. influenzae&lt;/em&gt;and &lt;em&gt;H. influenzae&lt;/em&gt; type b) had 95-99% similarity to NCBI sequences. The results of determining the biotype revealed that the studied strains were related to different biotypes.&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;/p&gt;

&lt;p&gt;&lt;strong&gt;&lt;em&gt;Conclusion:&lt;/em&gt;&lt;/strong&gt; The results of this study suggested that use of &lt;em&gt;oapA&lt;/em&gt; gene protein for production of vaccine against &lt;em&gt;H. influenzae&lt;/em&gt; type b be further considered.&amp;nbsp;&lt;/p&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>هموفیلوس آنفلوانزا؛ ژنoapA؛واکنش زنجیره‌ای پلیمراز</keyword_fa>
	<keyword>H. influenza,oapAgene,PCR</keyword>
	<start_page>17</start_page>
	<end_page>25</end_page>
	<web_url>http://journal.muq.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-100-206&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Parisa</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name> Rahimi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پریسا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رحیمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Alzahra University</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه الزهرا</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Parichehr</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name> Hanachi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پریچهر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حناچی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>hanachi_wrc@yahoo.com</email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Alzahra University</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشگاه الزهرا</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Saeed</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name> Bouzari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سعید</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بوذری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Pasteur Institute of Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>انستیتوپاستور ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Seyed Davar</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name> Siadat</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید داور</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سیادت</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code></code>
	<orcid></orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Pasteur Institute of Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>انستیتوپاستور ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
