دوره 13، شماره 6 - ( شهریور 1398 )                   جلد 13 شماره 6 صفحات 54-47 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print

Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Salehi M, Almasi I. The False Discovery Rate in Simultaneous Fisher and Adjusted Permutation Hypothesis Testing on Microarray Data. Qom Univ Med Sci J 2019; 13 (6) :47-54
URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-2397-fa.html
صالحی محسن، الماسی اسحاق. نرخ کشف کاذب در آزمون‌فرض‌ جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته‌ همزمان بر داده‌های ریزآرایه. مجله دانشگاه علوم پزشکی قم. 1398; 13 (6) :47-54

URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-2397-fa.html

نرخ کشف کاذب در آزمون‌فرض‌ جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته‌ همزمان بر داده‌های ریزآرایه
محسن صالحی* 1، اسحاق الماسی2
1- گروه آمار، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم ، m.salehi@qom.ac.ir
2- گروه ریاضی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه ایلام
چکیده:   (4180 مشاهده)
زمینه و هدف: در سال‌های اخیر، فن‌آوری‌های جدید منجر به تولید حجم انبوهی از داده‌ها شده و در حوزه‌ زیستی، فناوری ریزآرایه نیز به‌صورت چشمگیری توسعه یافته است. در این میان، جهت مقایسه گروه کنترل با دو یا چند گروه آزمایشی، همچنین یافتن ژن‌هایی با بیان متفاوت، از آزمون فیشر استفاده می‌شود. در این مطالعه نرخ کشف کاذب در آزمون‌فرض‌ جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته‌ همزمان بر داده‌های ریزآرایه بررسی گردید.
روش بررسی: در این مطالعه، ابتدا با شبیه‌سازی و انتخاب سه حالت مختلف برای نمونه‌های کنترل و آزمایشی‌، نرخ کشف کاذب با استفاده از دو روش آزمون جایگشتی فیشر و جایگشتی تعدیل‌یافته محاسبه گردید، سپس این دو روش بر روی 8799 ژن مربوط به سلول مغز 29 موش (در سه گروه سنی جوان، میانسال و پیر) اعمال گردید و تأثیر فرآیند سن مغز بر افزایش ایجاد بیماری آلزایمر مورد بررسی قرار گرفت.
یافته‌ها: نتایج نشان داد استفاده از روش آزمون جایگشتی فیشر، نرخ کشف کاذب را نمی‌تواند کنترل کند، ولی روش جایگشتی‌ تعدیل‌یافته بهتر عمل کرده و اختلافات واقعی معنی‌دار را درست‌تر تشخیص می‌دهد؛ لذا مقدار FP در روش دوم کاهش خواهد یافت.
نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج این مطالعه، استفاده از روش‌های مرسوم ازجمله آزمون جایگشتی فیشر که مبنای تحلیل داده‌های زیستی در بسیاری از نرم‌افزارها می‌باشد، در داده‌های بزرگ مقیاس، ازجمله داده‌های ریزآرایه کارایی مطلوب را ندارد و نرخ کشف کاذب را نمی‌تواند کنترل کند؛ درحالی‌که روش جایگشتی تعدیل‌یافته با عملکرد بهتر در کنترل نرخ کشف کاذب، نتایج قابل‌اعتمادتری در پی دارد.
واژه‌های کلیدی: ریزآرایه، بیان ژن، بیماری آلزایمر، نرخ کشف کاذب، روش‌ها.
متن کامل [PDF 673 kb]   (920 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشي | موضوع مقاله: آمار
دریافت: 1397/11/10 | پذیرش: 1398/4/10 | انتشار: 1398/5/24
ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA
ارسال پیام به نویسنده مسئول

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله دانشگاه علوم پزشکی قم می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق
© 2025 CC BY-NC 4.0 | Qom University of Medical Sciences Journal

Designed & Developed by : Yektaweb