دوره 14، شماره 5 - ( مرداد 1399 )
جلد 14 شماره 5 صفحات 29-22 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Shabani M, Mohammad Ganji S, Salahshourifar I. Investigation of Long Non-coding RNA HOX A11-AS Expression in Iranian Patients with Glioblastoma: A Quantitative Study. Qom Univ Med Sci J 2020; 14 (5) :22-29
URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-2816-fa.html
URL: http://journal.muq.ac.ir/article-1-2816-fa.html
شعبانی منصوره، محمد گنجی شهلا، سلحشوری فر ایمان. مطالعه کمّی میزان بیان lncRNA HOX A11As در بیماران ایرانی مبتلابه گلیوبلاستوما. مجله دانشگاه علوم پزشکی قم. 1399; 14 (5) :22-29
1- گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.
2- گروه پزشکی مولکولی، پژوهشکده بیوتکنولوژی پزشکی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست‌فناوری، تهران، ایران. ،shahlamg@yahoo.com
2- گروه پزشکی مولکولی، پژوهشکده بیوتکنولوژی پزشکی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست‌فناوری، تهران، ایران. ،
چکیده: (2766 مشاهده)
زمینه و هدف: گلیوبلاستوما یکی از بدخیم‌ترین و رایج‌ترین تومورهای مغزی است که حدود نیمی از گلیوماها را به خود اختصاص می‌دهد. گلیوبلاستوما یکی از تومورهای سیستم عصبی مرکزی (CNS: Central Nervous System) است که از بافت گلیال مغز نشئت می‌گیرد. هدف از این مطالعه بررسی تغییرات بیان lncRNA HOXA11-AS به‌عنوان بیومارکر احتمالی در گلیوماست.
روش بررسی: بدین منظور پس از بررسی پرونده پزشکی بیماران بیمارستان امام حسین تهران، گرفتن رضایت‌نامه کتبی از بیماران و گرفتن کد اخلاق این پژوهش در بیمارستان امام حسین انجام شد. بلوک‌های پارافینه شامل بیوپسی بافت توموری مغز از سال 1394 تا 1396 جمع‌آوری شد و متخصص پاتولوژیست آن‌ها را تأیید و تعیین درجه کرد. در این پروژه، 50 نمونه درجه 1 و2 و 50 نمونه درجه 3 و4 بررسی شد. برای تمام نمونه‌های بافتی اهداشده بیماران، استخراج RNA و سنتز cDNA صورت گرفت. سپس پرایمر و پروب اختصاصی طراحی و میزان بیان ژن HOXA11-AS با استفاده از روش Real-time PCR بررسی شد. میانگین سن افراد بررسی‌شده 416/16 ± 70/43 سال بود. تجزیه‌وتحلیل آماری داده‌ها به‌صورت توصیفی و تحلیلی با استفاده از نرم‌افزار SPSS نسخه 20 انجام شود. همچنین برای مقایسه میزان بیان این ژن در بافت تومورال با درجه پایین‌تر و بافت تومورال با درجه بالاتر از آزمون آماری تی مستقل استفاده شد.
یافته‌ها: نتایج نشان داد نمونه‌های توموری با درجه سه و چهار، 76/2 برابر نمونه‌های توموری با درجه یک و دو افزایش بیان (fold change) داشتند که ازنظر آماری این فاصله معنی‌دار است.
نتیجه‌گیری: نتایج بررسی کمّی نشان داد بیان ژن HOXA11-AS افزایش معنی‌داری با افزایش درجه بیماری دارد (0002/0P=).
روش بررسی: بدین منظور پس از بررسی پرونده پزشکی بیماران بیمارستان امام حسین تهران، گرفتن رضایت‌نامه کتبی از بیماران و گرفتن کد اخلاق این پژوهش در بیمارستان امام حسین انجام شد. بلوک‌های پارافینه شامل بیوپسی بافت توموری مغز از سال 1394 تا 1396 جمع‌آوری شد و متخصص پاتولوژیست آن‌ها را تأیید و تعیین درجه کرد. در این پروژه، 50 نمونه درجه 1 و2 و 50 نمونه درجه 3 و4 بررسی شد. برای تمام نمونه‌های بافتی اهداشده بیماران، استخراج RNA و سنتز cDNA صورت گرفت. سپس پرایمر و پروب اختصاصی طراحی و میزان بیان ژن HOXA11-AS با استفاده از روش Real-time PCR بررسی شد. میانگین سن افراد بررسی‌شده 416/16 ± 70/43 سال بود. تجزیه‌وتحلیل آماری داده‌ها به‌صورت توصیفی و تحلیلی با استفاده از نرم‌افزار SPSS نسخه 20 انجام شود. همچنین برای مقایسه میزان بیان این ژن در بافت تومورال با درجه پایین‌تر و بافت تومورال با درجه بالاتر از آزمون آماری تی مستقل استفاده شد.
یافته‌ها: نتایج نشان داد نمونه‌های توموری با درجه سه و چهار، 76/2 برابر نمونه‌های توموری با درجه یک و دو افزایش بیان (fold change) داشتند که ازنظر آماری این فاصله معنی‌دار است.
نتیجه‌گیری: نتایج بررسی کمّی نشان داد بیان ژن HOXA11-AS افزایش معنی‌داری با افزایش درجه بیماری دارد (0002/0P=).
نوع مطالعه: مقاله پژوهشي |
موضوع مقاله:
علوم پایه
دریافت: 1399/2/25 | پذیرش: 1399/5/1 | انتشار: 1399/5/10
دریافت: 1399/2/25 | پذیرش: 1399/5/1 | انتشار: 1399/5/10
فهرست منابع
1. 1. Malmer B, Henriksson R, Grönberg H. Familial brain tumours-genetics or environment? A nationwide cohort study of cancer risk in spouses and first‐degree relatives of brain tumour patients. Int J Cancer 2003;106(2):260-3. PMID: 12800203 [DOI:10.1002/ijc.11213]
2. Holland EC. Glioblastoma multiforme: the terminator. Proc Natil Acad Sci 2000;97(12):6242-4. PMID: 10841526 [DOI:10.1073/pnas.97.12.6242]
3. Diwanji TP, Engelman A, Snider JW, Mohindra P. Epidemiology, diagnosis, and optimal management of glioma in adolescents and young adults. Adolesc Health Med Ther 2017;8:99-113. PMID: 28989289 [DOI:10.2147/AHMT.S53391]
4. Baskaran S. New molecular approaches to glioblastoma therapy. [Doctoral Dissertation]. Uppsala: Acta Universitatis Upsaliensis; 2017. Link
5. Li Q, Jia H, Li H, Dong C, Wang Y, Zou Z. LncRNA and mRNA expression profiles of glioblastoma multiforme (GBM) reveal the potential roles of lncRNAs in GBM pathogenesis. Tumour Biol 2016;37(11):14537-52. PMID: 27604987 [DOI:10.1007/s13277-016-5299-0]
6. Chen G, Cao Y, Zhang L, Ma H, Shen C, Zhao J. Analysis of long non-coding RNA expression profiles identifies novel lncRNA biomarkers in the tumorigenesis and malignant progression of gliomas. Oncotarget 2017;8(40):67744-53. PMID: 28978068 [DOI:10.18632/oncotarget.18832]
7. Wheeler TM, Leger AJ, Pandey SK, MacLeod AR, Nakamori M, Cheng SH, et al. Targeting nuclear RNA for in vivo correction of myotonic dystrophy. Nature 2012;488(7409):111-5. PMID: 22859208 [DOI:10.1038/nature11362]
8. Seydoux G, Braun RE. Pathway to totipotency: lessons from germ cells. Cell 2006;127(5):891-904. PMID: 17129777 [DOI:10.1016/j.cell.2006.11.016]
9. Aldape K, Brindle KM, Chesler L, Chopra R, Gajjar A, Gilbert MR, et al. Challenges to curing primary brain tumours. Nat Rev Clini Oncol 2019;16(8):509-20. PMID: 30733593 [DOI:10.1038/s41571-019-0177-5]
10. Rahmati S, Emadi Baigi M. Glioblastoma multi form. First National Conference on Biological Sciences, Islamic Azad University, Falavarjan, Iran; 2012. Link
11. Califf RM. Biomarker definitions and their applications. Exp Biol Med (Maywood) 2018;243(3):213-21. PMID: 29405771 [DOI:10.1177/1535370217750088]
12. Noori-Daloii MR, Eshaghkhani Y. lncRNAs roles in cancer occurrence. Med Sci J Islam Azad Univ Tehran Med Branch 2015;25(3):163-82. Link
13. Reardon DA, Wen PY. Therapeutic advances in the treatment of glioblastoma: rationale and potential role of targeted agents. Oncologist 2006;11(2):152-64. PMID: 16476836 [DOI:10.1634/theoncologist.11-2-152]
14. Wang Q, Zhang J, Liu Y, Zhang W, Zhou J, Duan R, et al. A novel cell cycle-associated lncRNA, HOXA11-AS, is transcribed from the 5-prime end of the HOXA transcript and is a biomarker of progression in glioma. Cancer Lett 2016;373(2):251-9. PMID: 26828136 [DOI:10.1016/j.canlet.2016.01.039]
15. Cao K, Fang Y, Wang H, Jiang Z, Guo L, Hu Y. The lncRNA HOXA11-AS regulates Rab3D expression by sponging miR-125a-5p promoting metastasis of osteosarcoma. Cancer Manag Res 2019;11:4505-18. PMID: 31191012 [DOI:10.2147/CMAR.S196025]
16. Li B, Wang W, Miao S, Li G, Lv Y, Xiang C, et al. HOXA11-AS promotes the progression of oral squamous cell carcinoma by targeting the miR-518a-3p/PDK1 axis. Cancer Cell Int 2019;19(1):140. PMID: 31139017 [DOI:10.1186/s12935-019-0838-6]
17. Xu C, He T, Li Z, Liu H, Ding B. Regulation of HOXA11-AS/miR-214-3p/EZH2 axis on the growth, migration and invasion of glioma cells. Biomed Pharmacother 2017;95:1504-13. PMID: 28946213 [DOI:10.1016/j.biopha.2017.08.097]
18. Mu S, Ai L, Fan F, Sun C, Hu Y. Prognostic and clinicopathological significance of long noncoding RNA HOXA11-AS expression in human solid tumors: a meta-analysis. Cancer Cell Int 2018;18:1. PMID: 29308050 [DOI:10.1186/s12935-017-0498-3]
19. Zhang Z, Zhou J, Zhang J, Duan R, Pu P, Han L. Downregulation of lncRNA-HOXA11-AS modulates proliferation and stemness in Glioma cells. Chin Neurosurg J 2017;3(1):1-7. Link [DOI:10.1186/s41016-017-0091-6]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
حق تالیف (کپی رایت) برای مولفان محفوظ است.
صاحب امتیاز: دانشگاه علوم پزشکی قم
ناشر: انتشارات دانشگاه علوم پزشکی قم
شاپا چاپی: 7799-1375
شاپا الکترونیک: 1375-2008
ایمیل مجله: journal@muq.ac.ir
j.muq.ac@gmail.com
